直訳：その船は、出航した。
すでに出航したので、その船には乗れない。 つまり「もう手遅れだ」というようなニュアンス。
それをするには、もう手遅れ。 期限が過ぎていたり、タイミングを逃したり、時間が過ぎて気持ちが冷めてしまったり、 溝が深くなりすぎて関係が修復できなかったり。など。
似たようなフレーズ：
That door has closed.
（直訳：そのドアは、閉まった）
英語には、こんな感じで、イメージすることで、 なんとなく、その意味が理解できるようなフレーズが、たくさん。
出航した、その船には、もう乗れない。 閉まった、そのドアは、もう開くことができないかもしれません。
それでも、次の船が、やってくる。 自分が開くことのできる、次の扉がある。 これから進んでいける道が、ある。 だから、大丈夫。